Contexte et objectif : Le cancer du sein triple négatif (triple-negative breast cancer, TNBC) est un sous-type particulier du cancer du sein considéré comme le plus difficile à traiter, caractérisé par une forte tendance à la métastase et un mauvais pronostic pour les patients. Les fragments dérivés de tRNA (tRNA-derived fragment, tRF) sont une nouvelle classe de petites molécules d'ARN non codantes impliquées dans divers processus physiopathologiques. Précédemment, grâce au séquençage à haut débit des tRF et tiRNA, un tiRNA-Met suppresseur de tumeur a été isolé à partir des tissus TNBC. Cette étude vise à approfondir le rôle et le mécanisme d'action de tiRNA-Met dans la croissance et la métastase du TNBC. Méthodes : Les protéines spécifiques se liant à tiRNA-Met ont été sélectionnées et identifiées via RNA Pull-Down, chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (liquid chromatography-mass spectrometry, LC-MS) et immunoprécipitation d'ARN (RNA immunoprecipitation, RIP). La colocalisation entre tiRNA-Met et la protéine spécifique HNRNPF a été détectée par immunofluorescence cellulaire, et l'impact de tiRNA-Met sur l'expression de l'ARNm de HNRNPF et son niveau protéique a été évalué par PCR quantitative en temps réel (qRT-PCR) et Western blot. L'effet de la surexpression de tiRNA-Met sur le transcriptome des cellules MDA-MB-231 a été étudié à l'aide du séquençage ARN (RNA sequencing, RNA-seq), les voies de signalisation et gènes cibles régulés par tiRNA-Met ont été explorés ; le niveau de transcription du gène cible NECAB1 a été vérifié par qRT-PCR ; l'effet de la suppression de l'expression de HNRNPF sur l'expression de NECAB1 a été testé. Les niveaux d'expression de l'ARNm de HNRNPF et NECAB1 dans les tissus TNBC ont été analysés via les bases de données The Cancer Genome Atlas (TCGA) et GEPIA, le niveau protéique de HNRNPF a été étudié via la base UALCAN ; une analyse de survie pour NECAB1 et HNRNPF a été réalisée avec la base Kaplan-Meier Plotter. La surexpression de NECAB1 a été réalisée par transfection de plasmides dans les cellules MDA-MB-231 et BT-549, et la prolifération ainsi que l'invasion cellulaire ont été évaluées respectivement par les tests CCK-8 et Transwell. Suite à l'inhibition de tiRNA-Met et à la suppression de son expression, une surexpression de NECAB1 ou une inhibition de HNRNPF ont été effectuées, avec évaluation de la prolifération et de l'invasion cellulaires par les tests CCK-8 et Transwell. Résultats : tiRNA-Met se lie spécifiquement à HNRNPF et se localise principalement dans le cytoplasme ; la surexpression ou l'inhibition de tiRNA-Met n'affecte pas l'expression de l'ARNm et le niveau protéique de HNRNPF. La surexpression de tiRNA-Met et la suppression de HNRNPF favorisent significativement l'expression de NECAB1. Les analyses des bases TCGA, GEPIA et UALCAN montrent une expression significativement élevée de l'ARNm et de la protéine HNRNPF dans les tissus TNBC par rapport aux tissus adjacents, tandis que l'expression de NECAB1 est significativement réduite (P<0.05). Les analyses Kaplan-Meier Plotter montrent une corrélation positive entre le niveau d'expression de l'ARNm de NECAB1 et la survie des patients (P<0.05), tandis que le niveau d'expression protéique de HNRNPF est corrélé négativement (P<0.05). Par rapport aux cellules témoins, les cellules MDA-MB-231 et BT-549 surexprimant NECAB1 présentent une capacité de prolifération et d'invasion significativement réduite (P<0.05) ; la surexpression de NECAB1 ou la suppression de HNRNPF en présence d'une inhibition de tiRNA-Met inversent l'augmentation de la prolifération et de l'invasion induite par la suppression de tiRNA-Met. Conclusion : tiRNA-Met renforce l'expression de NECAB1 en se liant spécifiquement à HNRNPF, ce qui inhibe la progression maligne du TNBC.

cancer du sein triple négatif;fragments dérivés de tRNA;tiRNA-Met;HNRNPF;NECAB1