Antecedentes y objetivo: El cáncer de mama triple negativo (triple-negative breast cancer, TNBC) es un subtipo especial de cáncer de mama que resulta ser el más difícil de tratar, caracterizado por su alta tendencia a la metástasis y mal pronóstico para los pacientes. Los fragmentos derivados de tRNA (tRNA-derived fragment, tRF) son una clase nueva de moléculas pequeñas de ARN no codificantes que participan en diversos procesos fisiopatológicos. Anteriormente, a través de la secuenciación de alto rendimiento de tRF y tiRNA, se identificó en tejidos de TNBC el tiRNA-Met supresor de tumores. El presente estudio tiene como objetivo profundizar en el papel y mecanismo de tiRNA-Met en el crecimiento y la metástasis del TNBC. Métodos: Se usaron técnicas de RNA Pull-Down, cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas (liquid chromatography-mass spectrometry, LC-MS) y precipitación inmunitaria de RNA (RNA immunoprecipitation, RIP) para seleccionar e identificar proteínas específicas que se unen a tiRNA-Met. Se detectó la colocalización entre tiRNA-Met y la proteína específica HNRNPF mediante experimentos de inmunofluorescencia celular, y se evaluó el efecto de tiRNA-Met en la expresión de ARNm de HNRNPF y en los niveles proteicos mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcripción reversa cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) y Western blot. Se examinó el impacto de la sobreexpresión de tiRNA-Met en el transcriptoma de células MDA-MB-231 mediante secuenciación de RNA (RNA sequencing, RNA-seq), explorando las vías de señalización y genes diana regulados por tiRNA-Met; se verificó el nivel transcripcional del gen diana NECAB1 mediante qRT-PCR; se estudió el efecto de la disminución de la expresión de HNRNPF en la expresión de NECAB1. Se analizaron los niveles de expresión de ARNm de HNRNPF y NECAB1 en tejidos TNBC mediante las bases de datos The Cancer Genome Atlas (TCGA) y GEPIA, el nivel proteico de HNRNPF se analizó mediante la base de datos UALCAN; se realizó análisis de supervivencia de los genes NECAB1 y HNRNPF a través de la base Kaplan-Meier Plotter. Se sobreexpresó NECAB1 en células MDA-MB-231 y BT-549 mediante transfección de plásmidos, y se evaluó la proliferación y la invasión celular con ensayos CCK-8 y Transwell, respectivamente. Sobre una base de inhibición o silenciación de tiRNA-Met, se sobreexpresó NECAB1 o se inhibió HNRNPF, evaluando la proliferación y la invasión celular mediante ensayos CCK-8 y Transwell. Resultados: tiRNA-Met se une específicamente a HNRNPF y se localiza principalmente en el citoplasma; la sobreexpresión o silenciamiento de tiRNA-Met no afecta la expresión de ARNm ni el nivel proteico de HNRNPF. La sobreexpresión de tiRNA-Met y el silenciamiento de HNRNPF promueven significativamente la expresión de NECAB1. Los análisis de las bases TCGA, GEPIA y UALCAN mostraron que, en comparación con los tejidos adyacentes al cáncer, la expresión de ARNm y proteínas de HNRNPF en tejidos TNBC está significativamente elevada, mientras que la expresión de NECAB1 está significativamente reducida (P<0.05). El análisis de Kaplan-Meier Plotter mostró que el nivel de expresión de ARNm de NECAB1 se correlaciona positivamente con la supervivencia del paciente (P<0.05), mientras que la expresión proteica de HNRNPF se correlaciona negativamente (P<0.05). En comparación con las células control, las células MDA-MB-231 y BT-549 que sobreexpresan NECAB1 mostraron una capacidad de proliferación e invasión significativamente reducida (P<0.05); la sobreexpresión de NECAB1 o el silenciamiento de HNRNPF en la base de la inhibición de tiRNA-Met revertieron el aumento de la proliferación e invasión inducido por el silenciamiento de tiRNA-Met. Conclusión: tiRNA-Met mejora la expresión de NECAB1 mediante la unión dirigida a HNRNPF, lo que inhibe la progresión maligna del TNBC.
关键词
cáncer de mama triple negativo;fragmentos derivados de tRNA;tiRNA-Met;HNRNPF;NECAB1