《中国癌症杂志》自创刊以来，屡获嘉奖，具体包括：

1.2000年12月24日认真执行《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范》（国家新闻出版署1999.1颁布），在首届《CAJ-CD规范》执行评优活动中，主要规范数据达到标准要求，荣获《CAJ-CD规范》执行优秀奖。

2.2013年12月被评为“中国抗癌协会系列期刊优秀期刊”。

3.2016年6月荣获第二届上海市高校优秀科技期刊奖。

4.2017年12月8日获2017年度中国抗癌协会系列期刊优秀论文组织奖。

5.2018年5月获“第三届上海市高校精品科技期刊奖”

6.2018年10月21日被评为“2018年度中国高校百佳科技期刊”。

7.2019年9月荣获“第三届中国科技期刊青年编辑业务大赛”优秀组织奖。

8.2020年8月荣获“第四届中国科技期刊青年编辑业务大赛”优秀组织奖。

9.2020年12月《中国癌症杂志》“指南与共识”栏目入选2020年华东地区期刊“优秀栏目”。

10.2021年4月荣获第四届上海市高校精品科技期刊奖。

11.2022年11月被评为“2022年度中国高校科技期刊建设示范案例库百佳科技期刊”。

12. 2024年5月30日荣获第五届上海市高校精品科技期刊奖。
13. 2024年9月《中国癌症杂志》“指南与共识”栏目入选2024华东地区期刊“优秀栏目”；
14. 7篇文章入选“中国精品科技期刊顶尖学术论文(F5000)”。
15. 3篇论文入选首届“海上医刊高质量论文（SHMJ50）”。
16. 2024年12月获“2024年度中国高校科技期刊建设示范案例库百佳科技期刊”。